Высшим органом управления Гимназии является Совет управления Гимназии, в который входят члены Епархиального Совета учредителя Гимназии. Компетенция Совета управления Гимназии прописана в настоящем Уставе гимназии.
Коллегиальные органы управления осуществляют свою деятельность в соответствии с законодательством об образовании, настоящим Уставом и положениями о них, утверждаемые директором гимназии.
Коллегиальными органами управления в гимназии являются:
1. Положение о педагогическом совете;
2. Положение о попечительском совете;
3. Положение о родительском комитете;